Toliau pateikiamos svarbiausios ligos ar komplikacijos, kurias gali sukelti Vakarų Nilo karštinė:
Akys ir akių priedai (H00-H59).
- Optinis neuritas (regos nervo uždegimas).
Širdies ir kraujagyslių sistema (I00-I99)
- Miokarditas (uždegiminė ŽIV liga širdis raumenys) (reti).
Kepenys, tulžies pūslė ir tulžis latakai-kasa (kasa) (K70-K77; K80-K87).
- Hepatito (kepenų uždegimas) (retai).
Raumenų ir kaulų sistema ir jungiamasis audinys (M00-M99).
- Paralyžius (paralyžiaus požymiai).
Psichika - nervų sistema (F00-F99; G00-G99)
- Encefalitas (smegenų uždegimas) - dažnai būna vėlyvos pasekmės (50% atvejų); yra susijęs su padidėjusiu mirtingumu (mirtingumas, palyginti su bendru šia liga sergančių žmonių skaičiumi) vyresniems kaip 70 metų žmonėms (15–40%)
- Meningitas (meningitas).
- Poliradikulitas (daugelio nervų šaknų uždegimas).
Simptomai ir nenormalūs klinikiniai ir laboratoriniai radiniai, neklasifikuojami kitur (R00-R99).
- Ataksija (eisenos sutrikimas)
