Klasifikavimas pagal fermentų struktūrą Fermentai

Klasifikacija pagal fermentų struktūrą

Beveik visi fermentai (enzimai) yra baltymai ir gali būti klasifikuojami pagal baltymų grandinės ilgį: Be to, yra atskirų baltymų grandinių, turinčių keletą fermentų aktyvumų, jie vadinami daugiafunkciais fermentais.

  • Monomeriniai fermentai, susidedantys tik iš vienos baltymo grandinės
  • Oligomeriniai fermentai, susidedantys iš kelių baltymų grandinių (monomerų)
  • Daugelio fermentų grandinės fermentai (enzimai) kurios bendradarbiauja ir reguliuoja viena kitą. Šios fermentų grandinės katalizuoja vėlesnius ląstelės metabolizmo etapus.

Klasifikacija pagal kofaktorius

Tolesnė klasifikacija yra klasifikacija, įvertinus kofaktorius. Kofaktoriai, kofermentai ir substratai yra skirtingų medžiagų klasifikacijų pavadinimai, turintys įtakos biocheminėms reakcijoms per jų sąveiką su fermentai (enzimai). Aptariamos organinės molekulės ir jonai (daugiausia metalo jonai).

Grynus baltymų fermentus sudaro tik baltymai o aktyvų centrą formuoja tik aminorūgščių liekanos ir peptido pagrindas. Aminorūgštys yra organinių junginių klasė, turinti bent vieną karboksi grupę (-COOH) ir vieną amino grupę (-NH2). Holoenzimai susideda iš baltymo dalies, apoenzimo ir kofaktoriaus - mažos molekulės molekulės (be baltymų).

Abi kartu yra svarbios fermento funkcijai. Organinės molekulės kaip kofaktoriai vadinamos kofermentais. Jei jie yra kovalentiškai susieti su apoenzimu, jie vadinami protezavimo grupėmis arba sub substratu.

Protezinė grupė yra nebaltyminis komponentas, tvirtai (dažniausiai kovalentiškai) surištas su baltymais ir turintis katalizinį poveikį. Kosubstratai yra įvairių medžiagų klasifikacijų pavadinimai, kurie daro įtaką biocheminėms reakcijoms per jų sąveiką su fermentais. Kaip biokatalizatoriai, molekulės, kurios pagreitina organizmų reakcijas, fermentai pagreitina biochemines reakcijas. Jie sumažina aktyvacijos energiją, kurią reikia įveikti, kad medžiaga virstų.