Kliniškai akivaizdu varis trūkumas yra palyginti nedažnas. Serumas varis ir jo saugojimo forma su koeruloplazminas baltymai gali sumažėti iki 30% normalaus lygio, kol nepasireikš klinikiniai simptomai. Vienas iš dažniausiai pasitaikančių klinikinių požymių varis trūkumas yra anemija (anemija) ir visi susiję blyškumo ir nuovargis. Ši forma anemija neatsako geležies terapija, bet yra pataisomas pridedant vario. Manoma, kad šiuo atveju geležies transportas yra sutrikęs dėl žemos koncentracija of koeruloplazminas. Vario trūkumas taip pat gali sutrikdyti leukocitai (balta kraujas ląstelių) ir sukelti vadinamąją neutropeniją. Dėl to nukentėję asmenys yra labiau linkę į infekcijas. osteoporozė kūdikiams ir mažiems vaikams atsirado kitų kaulų vystymosi anomalijų dėl vario trūkumo.
Retesni vario trūkumo požymiai gali būti pigmentacijos sutrikimai, neurologiniai simptomai ir augimo sutrikimai.
