Fermentai

Fermentai yra cheminės medžiagos, kurių galima rasti visame kūne. Jie organizme inicijuoja chemines reakcijas.

Istorija

Žodį fermentas įvedė Wilhelmas Friedrichas Kühne'as 1878 m. Ir yra kilęs iš graikų dirbtinio žodžio fermentas, kuris reiškia mieles ar raugą. Tada jis atsidūrė tarptautiniame moksle. Tarptautinė grynosios taikomosios chemijos sąjunga (IUPAC) ir tarptautinė biochemijos sąjunga (IUBMB) kartu sukūrė fermentų nomenklatūrą, apibrėžiančią šios didelės grupės medžiagų atstovus kaip vieną bendrą grupę. Svarbu nustatyti atskirų fermentų užduotis yra įvardijimas, kuris klasifikuoja fermentus pagal jų užduotis.

Įvardijimo

Fermentų įvardijimas grindžiamas trimis pagrindiniais principais. Fermentų pavadinimai, pasibaigiantys -ase, apibūdina kelis fermentus vienoje sistemoje. Pats fermento pavadinimas apibūdina fermento inicijuojamą (katalizuojamą) reakciją.

Fermento pavadinimas taip pat yra fermento klasifikacija. Be to, buvo sukurta kodų sistema, EB numerių sistema, kurioje fermentus galima rasti pagal skaitmeninį keturių skaičių kodą. Pirmasis skaičius nurodo fermentų klasę.

Visų registruotų fermentų sąrašai užtikrina, kad nurodytą fermento kodą galima rasti greičiau. Nors kodai yra pagrįsti fermento katalizuojamos reakcijos savybėmis, skaitiniai kodai praktiškai nepasiteisina. Dažniau naudojami sistemingi pavadinimai, sukurti pagal minėtas taisykles.

Nomenklatūros problemos kyla, pavyzdžiui, su fermentais, kurie katalizuoja kelias reakcijas. Todėl kartais yra keli jų pavadinimai. Kai kurie fermentai turi nereikšmingus pavadinimus, kurie nerodo, kad paminėta medžiaga yra fermentas. Kadangi pavadinimai tradiciškai buvo plačiai naudojami, kai kurie iš jų išliko.

Klasifikacija pagal fermentų funkciją

Pagal IUPAC ir IUBMB, fermentai pagal jų inicijuojamą reakciją skirstomi į šešias fermentų klases: Kai kurie fermentai sugeba katalizuoti kelias, kartais labai skirtingas reakcijas. Tokiu atveju jie priskiriami kelioms fermentų klasėms.

  • Oksidoreduktazės Oksidoreduktazės sukelia redokso reakcijas.

    Šioje cheminėje reakcijoje elektronai perduodami iš vieno reagento į kitą. Tai lemia vienos medžiagos elektronų išsiskyrimą (oksidaciją) ir kitos medžiagos priėmimą (redukciją). Katalizuojamos reakcijos formulė yra A ?? + B? A? + B?

    A medžiaga išskiria elektroną (?) Ir oksiduojasi, o medžiaga B paima šį elektroną ir yra redukuota. Štai kodėl redokso reakcijos dar vadinamos redukcijos-oksidacijos reakcijomis.

    Daugelis medžiagų apykaitos reakcijų yra redoksinės reakcijos. Oksigenazės perduoda vieną ar kelis deguonies atomus į savo substratą.

  • Transferazės Transferazės perkelia funkcinę grupę iš vieno substrato į kitą. Funkcinė grupė yra organų junginių atomų grupė, kuri lemia medžiagos savybes ir reakcijos elgesį.

    Cheminiai junginiai, turintys tas pačias funkcines grupes, dėl panašių savybių yra grupuojami į medžiagų klases. Funkcinės grupės bus skirstomos pagal tai, ar jie yra heteroatomai, ar ne. Heteroatomai yra visi organinių junginių atomai, kurie nėra nei anglis, nei vandenilis.

    Pavyzdys: -OH -> hidroksilo grupė (alkoholiai)

  • Hidrolazės Hidrolazės skaido jungtis arba esterius, esterius, peptidus, glikozidus, rūgščių anhidridus arba CC jungtis grįžtamosiose reakcijose, naudodamos vandenį. Pusiausvyros reakcija yra: A-B + H2O? A-H + B-OH.

    Fermentas, priklausantis hidrolazių grupei, yra alfa galaktozidazė.

  • Liazės Liazės, dar vadinamos sintazėmis, katalizuoja kompleksinių produktų skaidymą iš paprastų substratų, neatskiriant ATP. Reakcijos schema yra AB? A + B. ATP yra adenozino trifosfatas ir nukleotidas, susidedantis iš nukleozido adenozino trifosfato (ir kaip tokio nukleorūgšties RNR didelės energijos statybinio bloko).

    Tačiau ATP daugiausia yra universali bet kurioje ląstelėje esančios energijos forma, kuri tuo pačiu metu yra svarbus energijos tiekimo procesų reguliatorius. ATP sintetinamas iš kitų energijos atsargų (kreatino fosfatas, glikogenas, riebalų rūgštys). ATP molekulę sudaro adenino liekanos, cukraus ribozė ir trys fosfatai (?

    iki?) esteryje (?) arba anhidrido jungtyje (?

    ir? ).

  • Izomerazės Izomerazės pagreitina izomerų cheminę konversiją. Izomerizmas yra dviejų ar daugiau cheminių junginių, turinčių tiksliai tuos pačius atomus (tą pačią molekulinę formulę) ir molekulines mases, tačiau kurie skiriasi atomų ryšiu ar erdviniu išdėstymu. Atitinkami junginiai vadinami izomerais.

    Šie izomerai skiriasi savo cheminėmis ir (arba) fizikinėmis savybėmis, taip pat dažnai ir biocheminėmis savybėmis. Izomerija pasireiškia daugiausia su organiniais junginiais, bet ir su (neorganiniais) koordinavimas junginiai. Izomerija skirstoma į skirtingas sritis.

  • Ligazės Ligazės katalizuoja cheminių medžiagų susidarymą, kurie yra chemiškai sudėtingesni už naudojamus substratus, tačiau, skirtingai nei liazės, yra fermentiškai aktyvūs tik skildami ATP. Todėl šioms medžiagoms susidaryti reikalinga energija, kuri gaunama skaidant ATP.